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Signes
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La 6ème extinction, 1ère Partie (The 6th Extinction I)
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Scully cherche un moyen de localiser l'origine du mal dont souffre Mulder et étudie des iéogrammes navajos retrouvés sur un vaisseau extraterrestre. Elle réalise que les aliens seraient peut être à l'origine de la vie humaine puis rejoint Mulder, qui se retrouve interné dans un état critique et victime d'intenses migraines.
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COMPLOT : Skinner et Kritschgau sont surpris par Diana Fowley alors qu'ils injectent une drogue à Mulder, et le vaisseau alien disparaît de l'endroit où il a été trouvé.
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Manipulations
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La 6ème Extinction, 2ème Partie (The 6th Extinction II Amor Fati)
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Sur son lit d'hôpital, Mulder est en proie au délire. Il reçoit la visite de l'Homme à la cigarette qui lui donne le chois : Abandonner les affaires non classées ou porsuivre sa quête de la vérité et mourir. Scully, de son côté, tente de rassembler les preuves d'une vie alien sur Terre, mais le FBI se met en travers de son chemin.
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COMPLOT : L'Homme à la cigarette annonce à Mulder le terrible secret qu'il refusait de considérer.
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Vampire ?
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Appétit monstre (Hungry)
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Un jeune homme se rend dans un fast-food, le Lucky Boy, et insiste pour se faire servir alors que l'établissement va fermer. Il sort de sa voiture et semble être happé par une créature monstrueuse. Chargés de l'enquête, Mulder et Scully découvrent à côté du cadavre défiguré un badge du Lucky Boy. Les deux agents décident d'interroger chacun des employés ...
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Rencontre
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Millenium (Millenium)
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Un cross-Over entre les deux séries de Chris Carter, X-Files et Millenium. Afin d'élucider une affaire de pillages de tombes, Mulder et Scully doivent consulter le profiler du FBI Franck Black, qui s'est fait volontairement interner dans un asile psychiatrique afin de prouver qu'il est apte à conserver la garde de sa fille.
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Surhumains
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A toute vitesse (Rush)
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Mulder et Scully sont appelés à enquêter sur le meurtre étrange d'un agent de police en Virginie qui semble avoir été victime d'un être invisible. Très vite, les soupçons des deux agents se portent sur un gorupe d'adolescents dont le meneur, fils du shérif de la ville, paraît être capable de se déplacer plus vite que la lumière.
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Mauvais numéro
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Chance (The Goldberg Variation)
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Mulder et Scully sont à Chicago pour enquêter sur la cas d'un homme, jeté du haut d'un immeuble, que des témoins ont vu se relever et partir sans une égratignure. Mulder soupçonne l'étranger d'avoir une chance hors du commun, qui doit cependant, loi cosmique oblige, s'équilibrer en apportant la malchance autour de lui.
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Come-Back
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Orison (Orison)
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Les deux agents doivent enquêter sur la disparition de détenus qui semblent s'évader grâce à un prêtre doté de pouvoirs hypnotiques. Mais l'un de ces fuyards va replonger Scully dans un passé qu'elle avait tenté d'occulter, car il s'agit du fétichiste Donnie Pfaster qui l'avait autrefois enlevée, sequestrée et torturée.
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Secrets Professionnels
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Maleeni le prodigieux (The Amazing Maleeni)
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Suite à un tour de magie spectaculaire, Maleeni le magnifique est retrouvé mort, la tête tranchée. Appelés pour enquêter sur cette étrange affaire, Scully et Mulder comprennent rapidement que dans ce monde de la prestidigitation, rien ne semble être ce qu'il paraît. Ce principe va régir leur enquête.
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Fanatique
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La Morsure du mal (Signs and Wonders)
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La mort mystérieuse d'un fanatique religieux pousseMulder et Scully à faire des recherches sur l'Eglise de Signes et des Miracles.Le prêcheur y fait des interprétations déviées de la Bible, allant même jusqu'à utiliser des serpents venimeux pour tester la foi de chacun de ses disciples.
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Kidnappings
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Délivrance, 1ère Partie (Sein und Zeit)
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Un homme a des visions de sa fillette morte et découvre que celle-ci n'est pas dans sa chambre. Parallèlement, Mulder et Scully enquêtent sur la diqparition de jeunes enfants enlevés ou assassinés par leurs parents. Mulder est hanté par les souvenirs de Samantha, sa soeur disparue vingt sept ans plus tôt.
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COMPLOT : Mulder a toujours cru que Samantha avait été enlevée par des extraterrestres. Peut être est il temps de réfuter cette thèse.
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Samantha
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Délivrance, 2ème Partie (Closure)
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Milder fait le deuil de sa mère, mais a du mal à croire que sa soeur est morte. Ed Truelove, un tueur d'enfants, est finalement arrêté, et Teena Mulder ne semble pas faire partie de ses victimes. Mulder va enfin découvrir toute la vérité quant à la disparition de sa soeur. Mais est-il vraiment prêt à l'entendre ?
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COMPLOT : Quel rapport existe t'il entre l'Homme à la cigarette et Teena Mulder ?
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Le Ca
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Peur Bleue (X Cops)
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Un homme se fait attaquer par quelque chose qui ressemble à un loup garou. Mulder et Scully commencent leur enquête, perturbée par le tournage de l'émission "Cops". Les deux agents se retrouvent, malgré eux, partie intégrante du show de téléréalité. Quant à la mystérieuse créature, elle semble changer de forme et s'incarner dans les peurs de ses victimes ...
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"Je" Vidéo
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Maitreya (First Person Shooter)
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Le participant d'un jeu de réalité virtuelle est tué en pleine partie par une déesse digitale, que personne ne semble avoir programmé. Les créateurs et les actionnaires du jeu tentent de cacher le meurtre aux médias, mais ne peuvent empêcher Mulder et Scully de poursuivre leur enquête. Qui se cache derrière cette créature ?
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Fatalité
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Coup du Sort (Theef)
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Un neurologiste apprécié de tous voit les membres de sa famille mourir un à un dans des circonstances atroces. Mulder devient progressivement convaincu que cet homme est la cible de rituels de possession vaudous. Les menaces de mort se multiplient alors que Mulder et Scully enquêtent sur un dénommé Orel Peatty.
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L'ancien ennemi
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En Ami (En Ami)
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Scully rencontre un enfant, guéri par miracle d'un cancer incurable par des "anges venus du ciel". Elle croise également la route de l'Homme à la cigarette, qui lui confie qu'il est mourant, et veut lui transmettre un secret qui permettrait de guérir la majorité des cancers de l'humanité. Elle fausse compagnie à Mulder pour suivre l'ancien ennemi ...
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COMPLOT : L'Homme à la cigarette suit Scully depuis ses débuts et la connaît bien. Est ce par affection ou par calcul ? Cherche t'il seulement à se sauver lui-même ?
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Utopie
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Chimère (Chimera)
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Dans une banlieue américaine d'apparence paisible, le cadavre d'une femme est retrouvée le visage lacéré par des griffes de corbeau. La femme du shérif semble hantée par le reflet inquiétant d'un monstre qui apparaît dans les miroirs. Les meurtres se multiplient et Mulder est amené à enquêter.
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Foi
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Existences ( All Things)
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Scully laisse Mulder se lancer seul sur une piste dont elle réfute le bien-fondé. Dans un hôpital, une étrange cöïncidence la mène jusqu'à Daniel Waterston, dont elle a partagé la vie dix ans plus tôt. Les hasards s'enchaînent et l'esprit scientifique de Scully est mis à rude épreuve au profit de sa foi.
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Insider
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Nicotine (Brand X)
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Alors que Skinner est chargé de protéger un homme travaillant sur les projets secrets de la Morley Tobacco, qui doit témoigner contre son employeur, ce témoin trouve la mort dans des conditions inexpliquées. Grâce à l'aide de ses agents Scully et Mulder, Skinner va tenter de découvrir ce que le géant du tabac cache comme horrible expérience.
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Postmoderne
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Hollywood (Hollywood A.D.)
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Alors que Mulder et Scully enquêtent sur un attentat survenu dans une église, un ami de Skinner les suit afin d'écrire un scénario et d'adapter librement leur enquête au cinéma. Alors que nos deux agents suivent une étrange piste qui les fait remonter jusqu'à Jésus et Lazare, ils deviennent malgré eux des modèles pour une sombre histoire de Zombies.
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Doppelgangers
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Doubles (Fight Club)
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A Kansas City, des bagarres sanglantes éclatent sur le passage de Lulu et Bettie, deux femmes étrangement identiques. Scully et Mulder mènent l'enquête et s'apperçoivent rapidement qu'ils sont face à des doubles qui, depuis douze ans, suivent la même route en ne laissant que des ruines sur leur passage.
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Djinn
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Je souhaite (Je souhaite)
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Un homme, méprisé par tous, réveille malencontreusement un mauvais génie en déroulant un tapis antique. Il se voit accorder trois voeux qui vont transformer sa vie en un véritable cauchemar et créer autour de lui toutes sortes d'incidents étranges. Chargés de l'enquête, Mulder et Scully tentent de demêler le vrai du faux dans cette histoire incroyable ...
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Genèse
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Requiem (Requiem)
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Mulder et Scully retournent à Bellefleur, Oregon, le lieu de leur première affaire ensemble. Sept ans après, les mêmes évènements semblent se reporduire. Lors de l'enquête, Mulder disparaît mystérieusement, alors que des aliens paraissent prendre la forme de certains habitants de la région. Scully, prise de malaises étranges, est hospitalisée ...
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COMPLOT : Pourquoi l'Homme à la cigarette se décide t'il à faire sortir Krycek de prison ?
